一、選擇地下水比較低，排數比較好的地方來做育苗基地，還有就是需要選擇無毒原菌的土壤配置營養土堅持輪作制度。
二、需要將病菌殺掉，在育苗之前使用枯枝、枯葉、干草均勻撒在苗床上，然后點燃這樣是可以殺死土壤仲的病原菌。
三、肥料以農家肥為主，化肥為輔。垃圾肥和堆肥、廄肥可能帶菌，應堆置發酵腐熟后才能使用。用草木灰做基肥能夠有效的防止莖腐病。
四、高溫季節搭蔭棚，可降低苗床溫度，可使發病率減少85%以上。
五、出苗期開始，每畝苗圃用波爾多液50至75公斤噴灑幼苗，使幼苗外表形成保護膜，防止病菌侵入。
以上就是防治苗木莖腐病的方法，希望此文章能夠給您帶來幫助。